Nếu đơn đăng ký không đầy đủ, chủ đơn sẽ được thông báo về những thiếu sót bằng một lá thư chính thức từ USPTO. Chủ đơn sẽ có một khoảng thời gian để hoàn thành việc nộp đơn (có thể phải trả phụ phí). Nếu thiếu sót không được sửa chữa trong một khoảng thời gian nhất định, ứng dụng sẽ được trả lại hoặc xử lý theo cách khác; phí nộp đơn nếu đã nộp sẽ được hoàn trả trừ đi phí xử lý như quy định trong biểu phí.

Khi đơn đăng ký đã được chấp nhận là hoàn chỉnh, nó sẽ được chỉ định để kiểm tra. Thẩm định viên sẽ xem xét nội dung của đơn đăng ký để xác định xem đơn đăng ký có đáp ứng các yêu cầu bảo hộ theo quy định của USPTO. Thẩm định viên cùng chủ đơn sẽ cùng trao đổi các nội dung liên quan đến đăng ký bảo hộ để xác định đồng ý hoặc từ chối việc cấp bằng. Nếu đơn đăng ký của chủ đơn bị từ chối hai lần, chủ đơn có thể kháng cáo quyết định của thẩm định viên lên Hội đồng Xét xử và Kháng cáo Bằng sáng chế (PTAB).