Phòng thí nghiệm Công nghệ sinh học phân tử thành lập năm 2000, có chức năng phục vụ nghiên cứu khoa học và hợp tác quốc tế về công nghệ sinh học, góp phần nâng cao chất lượng đào tạo để tiến kịp trình độ khoa học của khu vực và thế giới, phục vụ sự phát triển bền vững của đất nước.

Phòng thí nghiệm trọng điểm ĐHQG-HCM Nghiên cứu Cấu trúc Vật liệu tập trung phát triển các phương pháp mới trong tổng hợp hữu cơ, chủ yếu dựa trên việc sử dụng lưu huỳnh nguyên tố làm chất gây dựng cấu trúc hoặc xúc tác, cũng như các phương pháp sử dụng kim loại chuyển tiếp đơn giản.

Phòng thí nghiệm trọng điểm ĐHQG-HCM Công nghệ Hóa học và Dầu khí thành lập năm 2009 tập trung vào tổng hợp và ứng dụng vật liệu tiên tiến phục vụ các lĩnh vực năng lượng bền vững, môi trường và y sinh

Phòng thí nghiệm trọng điểm ĐHQG-HCM Công nghệ xử lý chất thải bậc cao thành lập năm 2009, có chức năng nghiên cứu khoa học, phát triển công nghệ và hỗ trợ đào tạo.

Phòng thí nghiệm trọng điểm Vật liệu Polyme và Compozit thành lập năm 2003 với chức năng chính là nghiên cứu khoa học và triển khai ứng dụng trong lĩnh vực công nghệ vật liệu polyme và compozit phục vụ cho các ngành kinh tế - kỹ thuật

Phòng thí nghiệm trọng điểm Điều khiển số và Kỹ thuật hệ thống thành lập năm 2003

Phòng Thí nghiệm Trọng điểm ĐHQG-HCM Công nghệ Vật liệu có chức năng nghiên cứu, triển khai và ứng dụng các công nghệ tiên tiến trong lĩnh vực vật liệu, phục vụ cho đào tạo, nghiên cứu khoa học và chuyển giao công nghệ.